繼1995年，第一批入選“211工程”的15所大學之后， 1996年中國人民大學等院校及1997年北京科技大學等院校和隨后1998年等等一批又一批的大學進入“211工程”，使入選“211”工程大學總共達到95所。2003年教育部公布的這95所大學的名單如下：

    北京大學、中國人民大學、清華大學、北京交通大學、北京工業大學、北京航空航天大學、北京理工大學、北京科技大學、北京化工大學、北京郵電大學、中國農業大學、北京林業大學、北京中醫藥大學、北京師范大學、北京外國語大學、北京廣播學院、對外經濟貿易大學、中央民族大學、中央音樂學院、南開大學、天津大學、天津醫科大學、河北工業大學、太原理工大學、內蒙古大學、遼寧大學、大連理工大學、東北大學、大連海事大學、吉林大學、延邊大學、東北師范大學、哈爾濱工業大學、哈爾濱工程大學、東北農業大學、復旦大學、同濟大學、上海交通大學、華東理工大學、東華大學、上海第二醫科大學、華東師范大學、上海外國語大學、上海財經大學、上海大學、南京大學、蘇州大學、東南大學、南京航空航天大學、南京理工大學、中國礦業大學、河海大學、江南大學、南京農業大學、中國藥科大學、南京師范大學、浙江大學、安徽大學、中國科學技術大學、廈門大學、福州大學、南昌大學、山東大學、中國海洋大學、石油大學、鄭州大學、武漢大學、華中科技大學、中國地質大學、武漢理工大學、湖南大學、中南大學、湖南師范大學、中山大學、暨南大學、華南理工大學、華南師范大學、廣西大學、四川大學、重慶大學、西南交通大學、電子科技大學、四川農業大學、西南財經大學、云南大學、西北大學、西安交通大學、西北工業大學、西安電子科技大學、長安大學、蘭州大學、新疆大學、第二軍醫大學、第四軍醫大學、國防科學技術大學