數理系是由原數學教研室和大學物理教研室發展而來。數理系目前有教職工53人，其中教授、副教授15名、博士后2人、博士10人，有碩士以上學歷教師占90%以上．年齡在30至50歲的教師占80%。近兩年來，全系教師獲得省、部、市和學校各種獎勵30多項；承擔的在研項目20多項，其中省科技廳項目3項，教育廳項目5項，廈門市項目10多項；承擔的教研教改及教學質量工程項目10多項。近年來在國內外學術期刊上發表論文300多篇，出版書著、教科書10多部。數理系有省和國家專業學會理事、理事長，國際專業學會評論員和廈門市評估專家等學術兼職的教師多人。近兩年數理系教師指導的大學生數學建模競賽獲得國家和賽區獎勵10項。
　　數理系現有“信息與計算科學”、“數學與應用數學”、“光信息科學與技術”三個本科專業。設信息與計算科學教研室、數學與應用數學教研室、高等數學教研室、光電信息技術教研室、大學物理教研室等五個教研室；設有物理教學實驗中心，包括大學物理實驗室、光電信息技術實驗室；設有信息與計算科學實驗室；擁有1個省級重點學科——光學工程、1個工程中心——光電信息工程技術研究中心、1個省級高校重點實驗室（培育）——光電技術重點實驗室和1個研究所——數學研究所。

　　2005年大學物理實驗室獲財政部“共建”項目資助。2008年物理教學實驗中心被確認為校級示范中心，光電信息技術實驗室獲財政部“中央與地方共建高校特色優勢學科”項目的立項和資助。2008年光信息科學與技術專業被列為校級特色專業，重點加以建設，成為我校首批重點建設的特色專業。

　　數理系注重“實驗技能、理論思維和科學計算”等素質的培養，專業學科建設、實踐基地建設保持與行業發展同步，聘請著名專家擔任兼職教授，先后與廈門、北京等地的相關企業和研究所共建實踐教學基地，構建科技創新實踐平臺，實現“產、學、研”相結合，培養適應21世紀社會主義現代化建設需要，尤其是適應海峽西岸經濟區建設與發展需要的專業人才。

　　信息與計算科學專業（本科四年）

　　【培養目標】

　　本專業培養具有良好的數學基礎和計算機基礎，掌握信息科學和計算科學的基本理論與方法，以及計算機軟件設計與操作技能，接受創新思維和實際應用能力的訓練，在科技、教育、經濟、管理部門從事各類信息處理、計算機應用軟件開發和管理等技術工作及教學科研工作的高級專門人才。

　　【主要課程】

　　數學分析、高等代數、解析幾何、概率論與數理統計、算法與數據結構、數字圖像處理、離散數學、信息科學基礎、數學模型、信息與計算機安全技術、數據庫原理及應用、網絡編程、軟件工程、運籌與優化等。

　　【就業方向】

　　畢業生可在科技、教育、經濟、管理部門從事各類信息處理、數值計算、應用軟件開發等方面的研究、教學和管理等工作，也可繼續攻讀應用數學、計算機應用、通信、經濟管理以及相關專業的碩士學位。

　　光信息科學與技術專業（本科四年）

　　【培養目標】

　　本專業培養具備光信息科學與技術的基本理論、基本知識、基本技能和專業知識，能在應用光學、光電子學、光通信、光學信息處理、光電檢測、光電信息顯示與存儲，以及電子信息等相關領域，特別是光、機、電、算一體化產業，從事科學研究、教學、產品設計、生產技術或管理等工作的光信息科學與技術高級專門人才。

　　【主要課程】

　　物理光學、應用光學、光電子學、光電傳感與檢測技術、激光原理與技術、光電器件及其應用、信息光學、光通信原理等。

　　【就業方向】

　　畢業生可在應用光學、光信息工程與技術、光通信工程與技術、光電信號檢測處理與控制技術及其相關領域從事各類光電信息技術與系統的科學研究與教學、應用設計與科技開發、制造與項目（企業）管理等方面的工作。畢業生還可以繼續攻讀光學工程、光學、電子科學與技術以及相關專業的碩士學位。

　　數學與應用數學專業（金融數學方向，本科四年）

　　【培養目標】

　　本專業培養擁有扎實寬廣的數學理論基礎和借助數學、計算機技術解決實際問題能力，具備較廣泛的適應性和較強的發展潛力，能夠在社會各領域特別是經濟金融領域從事與應用數學相關的研究與開發工作的高級專門人才。

　　【主要課程】

　　數學分析、高等代數、解析幾何、微分方程、概率統計、計算方法、數學建模、抽象代數、微分幾何、程序設計、實變函數與泛函分析、多元統計分析、宏觀與微觀經濟學、金融數學、計量經濟學等。

　　【就業方向】

　　畢業生能夠在社會各領域，如工農業、交通運輸、天文氣象、航空航天、地質礦產、軍事、教育、管理等領域特別是經濟與金融領域從事與應用數學相關的工作，能夠在計算中心、計算站承擔數學模型和應用軟件的研究與開發工作。也可繼續攻讀現代數學、應用數學、經濟、金融、管理、精算、保險、信息、軟件工程等方向的碩士學位。