1998年5月，江澤民同志在北京大學百年校慶大會上提出“為了實現現代化，我國要有若干所具有世界先進水平的一流大學”，教育部自1999年起分別與部分省、市地方政府簽訂合作協議，分批將34所國內知名高校列入國家跨世紀重點建設的高水平大學名單，由國家、地方以及相關部委共同出資建設。列入“985工程”院校的名單如下：
       

全國985工程院校名單

985工程院校名單（共39所）
北京（8所）	清華大學	北京大學	中國人民大學
	北京師范大學	北京理工大學	北京航空航天大學
	中國農業大學	中央民族大學
上海（4所）	復旦大學	同濟大學	上海交通大學
	華東師范大學
天津（2所）	南開大學	天津大學
江蘇（2所）	南京大學	東南大學
廣東（2所）	中山大學	華南理工大學
陜西（3所）	西安交通大學	西北工業大學	西北農林科技大學
湖北（2所）	武漢大學	華中科技大學
山東（2所）	山東大學	中國海洋大學
四川（2所）	四川大學	電子科技大學
湖南（2所）	湖南大學	中南大學
黑龍江（1所）	哈爾濱工業大學
遼寧（2所）	東北大學	大連理工大學
吉林（1所）	吉林大學
安徽（1所）	中國科學技術大學
福建（1所）	廈門大學
重慶（1所）	重慶大學
浙江（1所）	浙江大學
甘肅（1所）	蘭州大學
軍事系統（1所）	國防科學技術大學