1、病毒類：無細胞結構，主要由蛋白質和核酸組成，包括病毒和亞病毒(類病毒、擬病毒、朊病毒)

　　①動物病毒：RNA類(脊髓灰質炎病毒、狂犬病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒、流感病毒、艾滋病病毒、口蹄疫病毒、腦膜炎病毒、SARS病毒)

　　DNA類(痘病毒、腺病毒、皰疹病毒、虹彩病毒、乙肝病毒)

　　②植物病毒：RNA類(煙草花葉病毒、馬鈴薯X病毒、黃瓜花葉病毒、大麥黃化病毒等)

　　③微生物病毒：噬菌體

　　2、原核類：具細胞結構，但細胞內無核膜和核仁的分化，也無復雜的細胞器，包括：細菌(桿狀、球狀、螺旋狀)、放線菌、藍細菌、支原體、衣原體、立克次氏體、螺旋體。

　　① 細菌：三冊書中所涉及的所有細菌的種類：乳酸菌、硝化細菌(代謝類型);肺炎雙球菌S型、R型(遺傳的物質基礎);結核桿菌和麻風桿菌(胞內寄生菌);根瘤菌、圓褐固氮菌(固氮菌);大腸桿菌、枯草桿菌、土壤農桿菌(為基因工程提供運載體，也可作為基因工程的受體細胞);蘇云金芽孢桿菌(為抗蟲棉提供抗蟲基因);假單孢桿菌(分解石油的超級細菌);甲基營養細菌、谷氨酸棒狀桿菌、黃色短桿菌(微生物的代謝);鏈球菌(一般厭氧型); 產甲烷桿菌(嚴格厭氧型)等

　　②放線菌：是主要的抗生素產生菌。它們產生鏈霉素、慶大霉素、紅霉素、四環素、環絲氨酸、多氧霉素、環已酰胺、氯霉素和磷霉素等種類繁多的抗生素(85%)。繁殖方式為分生孢子繁殖。

　　③衣原體：砂眼衣原體。

　　3、滅菌：是指殺死一定環境中所有微生物的細胞、芽孢和孢子。實驗室最常用的是高壓蒸汽滅菌法。

　　4、真核類：具有復雜的細胞器和成形的細胞核，包括：酵母菌、霉菌(絲狀真菌)、蕈菌(大型真菌)等真菌及單細胞藻類、原生動物(大草履蟲、小草履蟲、變形蟲、間日瘧原蟲等)等真核微生物。

　　霉菌：可用于發酵上工業，廣泛的用于生產酒精、檸檬酸、甘油、酶制劑(如蛋白酶、淀粉酶、纖維素酶等)、固醇、維生素等。在農業上可用于飼料發酵、生產植物生長素(如赤酶霉素)、殺蟲農藥(如白僵菌劑)、除草劑等。危害如可使食物霉變、產生毒素(如黃曲霉毒素具致癌作用、鐮孢菌毒素可能與克山病有關)。常見霉菌主要有毛霉、根霉、曲霉、青霉、赤霉菌、白僵菌、脈胞菌、木霉等。

　　5、微生物代謝類型：①光能自養：光合細菌、藍細菌(水作為氫供體)紫硫細菌、綠硫細菌(H2S作為氫供體，嚴格厭氧)

　　2H2S+CO2→(CH2O)+H2O+2S

　　②光能異養：以光為能源，以有機物(甲酸、乙酸、丁酸、甲醇、異丙醇、丙酮酸、和乳酸)為碳源與氫供體營光合生長。陽光細菌利用丙酮酸與乳酸用為唯一碳源光合生長。

　　③化能自養：硫細菌、鐵細菌、氫細菌、硝化細菌、產甲烷菌(厭氧化能自養細菌)

　　CO2+4H2→CH4+2H2O

　　④化能異養：寄生、腐生細菌。

　　⑤好氧細菌：硝化細菌、谷氨酸棒狀桿菌、黃色短桿菌等

　　⑥厭氧細菌：乳酸菌、破傷風桿菌等

　　⑦ 中間類型：紅螺菌(光能自養、化能異養、厭氧[兼性光能營養型])、氫單胞菌(化能自養、化能異養[兼性自養])、酵母菌(需氧、厭氧[兼性厭氧型])

　　⑧ 固氮細菌：共生固氮微生物(根瘤菌等)、自生固氮微生物(圓褐固氮菌)